Are următoarea structură:
- Laboratorul examinări tehnice a documentelor,
- Laboratorul grafoscopic,
- Laboratorul traseologic,
- Laboratorul evidenţe dactiloscopice.

Tipurile de expertiză şi constatări tehnico-ştiinţifice efectuate:
- dactiloscopice;
- a armei albe;
- traseologice;
- tehnice a documentelor;
- grafoscopice;
- a portretului.

Laboratorul examinări tehnice a documentelor

Examinarea tehnico-criminalistică a documentelor se efectuează în cazul în care se solicită stabilirea autenticităţii anumitor documente, al faptului falsificării lor complete sau parţiale.

În cadrul examinării tehnico-criminalistice a documentelor pot fi soluţionate următoarele probleme: 
-  metoda confecţionării blanchetelor documentelor;
-  examinarea impresiunilor de ştampilă;
-  stabilirea conţinutului iniţial al documentului şi al metodei de modificare a acestuia;
-  examinarea fotografiei din documentul prezentat pentru stabilirea faptului schimbării acesteia;
-  consecutivitatea executării rechizitelor documentului (impresiunii de ştampilă şi textului, textului şi semnăturii ş.a.);
-  identificarea maşinii de scris;
-  examinarea bancnotelor şi hîrtiilor de valoare.

Laboratorul grafoscopic

Obiecte ale examinărilor grafoscopice pot fi atît textele mari ca volum (scrisori, agende etc.), cît şi înscrisurile scurte, semnăturile, cifrele, simbolurile, în care s-au relevat caracteristicile stabile şi individuale ale scrisului.

Prin acest gen de examinări pot fi soluţionate următoarele probleme:
-  identificarea persoanei după scrisul de mînă;
-  identificarea persoanei după semnătură;
-  stabilirea genului persoanei care a efectuat scrisul;
-  stabilirea faptului că una şi aceeaşi persoană a executat diferite texte sau semnături.

În cadrul laboratorului se efectuează şi examinarea de portret (stabilirea dacă două sau mai multe fotografii reprezintă aceeaşi persoană).

De asemenea, este gestionată colecţia bancnotelor şi hîrtiilor de valoare. 

Laboratorul traseologic

Examinarea traseologică are un aport mare la descoperirea crimelor prin stabilirea şi explicarea mecanismului de formare a urmelor, identificarea obiectului creator de urme sau persoana căreia îi aparţine urmele ridicate de la faţa locului, de asemenea, poate stabili împrejurările în care s-a produs infracţiunea concretă.

În cadrul examinării tehnico-criminalistice traseologice pot fi soluţionate următoarele probleme:
- stabilirea stării de funcţionare a sistemelor de închidere şi funcţionare;
- identificarea instrumentelor folosite la forţarea sistemelor de închidere şi asigurare;
- stabilirea modului de funcţionare a dispozitivelor folosite la forţarea sistemelor de închidere şi asigurare;
- examinarea sigiliilor şi identificarea preselor de asigurare (plumbuire);
- examinarea traseologică a mecanismelor de măsurare (contoare);
- stabilirea întregului după părţile sale componente;
- identificarea obiectelor de îmbrăcăminte şi încălţăminte;
- identificarea mijloacelor de transport după urmele create;
- identificarea instrumentelor de lovire (contondente, tăietoare, tăietoare-înţepătoare, tăietoare-despicătoare, înţepătoare);
- identificarea seriilor şi numerelor de pe obiecte (autoturisme, arme de foc etc.);
- identificarea persoanei după:
- urmele de dinţi,
- urmele de urechi,
- urmele de buze, nas sau altor zone ale corpului.

În cadrul laboratorului sunt gestionate:
- colecţia traseologică de specimene ale sigiliilor şi mijloacelor de asigurare,
- colecţia armelor albe.

 Laboratorul evidenţe dactiloscopice

În Laborator sunt efectuate examinările dactiloscopice. Evidenţa dactiloscopică este gestionată prin intermediul Sistemului automatizat de identificare a amprentelor digitale DACTO-2000.

În Direcţie se gestionează masivul urmelor papilare ridicate de la faţa locului crimelor nedescoperite.

Verificările sunt efectuate inclusiv şi pe masivele fişelor dactiloscopice ale persoanelor supuse înregistrării dactiloscopice conform Legii cu privire la înregistrarea dactiloscopică de stat nr.1549-XV din 19.12.2002. Acestea permit identificarea persoanei după urmele lăsate la faţa locului diferitor crime.